中国农业科学院作物科学研究所6044份水稻现代品种揭示中国主要稻区品种形成特征，助力水稻精准设计育种

发布日期: 13 March 2025

中国农业科学院作物科学研究所水稻优异种质资源发掘与创新利用团队联合作物种质资源安全保存与信息化、 作物生物信息与大数据团队在Molecular Plant发表了题为“Large-scale genomic and phenomic analyses of modern cultivars empower future rice breeding design” 的研究论文。该研究针对中国五大稻区的6044份现代水稻品种进行深度全基因组重测序，结合五大稻区19个鉴定点212组表型数据， 系统阐明了不同稻区水稻品种基因组和表型选择特征，多维度揭示了不同稻区品种适应性以及人文选择影响。 基于以上数据，鉴定到3131个与抽穗期、产量以及逆境响应等关键农艺性状显著相关的QTL，并克隆到水稻粒形调控新基因OsGL3.6。 进一步结合已发表数据，完成了近万份水稻资源/品种的高密度变异图谱的构建，并开发在线育种辅助工具， 打造了全球最大的水稻资源育种综合数据平台——RiceAtlas (https://www.cgris.net/RiceAtlas)，研究人员利用该平台成功快速改良“绥粳4号”水稻粒形。 该研究成果为水稻精准设计育种的智能决策提供重要的理论依据和数据支撑，是继“3K水稻基因组计划”之后，全球水稻种质资源和育种研究的又一巨大飞跃。
文章链接: https://doi.org/10.1016/j.molp.2025.03.007

中国农业科学院作科所构建谷子模式品种定向突变筛选数据库

发布日期: 03 March 2025

中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用团队，构建了谷子模式品种Ci846的基因组饱和突变体库及定向突变筛选网络数据库， 为谷子功能基因组研究和分子设计育种提供了高效研究工具。相关研究成果在线发表在《植物生物技术（Plant Biotechnology Journal）》上。
文章链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14594

高质量的糜子基因组为大规模种质资源的挖掘与利用开启新篇章

发布日期: June 9, 2023

中国农业科学院作物科学研究所特色作物优异种质资源发掘与创新利用研究团队，通过对糜子种质资源的基因组变异与群体结构进行系统分析， 成功构建了首个高质量糜子基因组图谱。该研究系统阐明了糜子的起源与驯化过程，从群体遗传学角度提供了支持“糜子起源于中国”的单一起源假说的有力证据。 此外，研究团队还对1,844份糜子及其野生近缘种——绿色狗尾草的核心种质资源开展了深入分析，鉴定出1,084个与重要农艺性状相关的位点和基因。 在此基础上，研究构建了基于基因组图谱的精准高效育种方法，为突破性新品种的选育提供了坚实的理论基础与技术路径。相关研究成果发表于《Nature Genetics》。
文章链接: https://www.nature.com/articles/s41588-023-01423-w